Penelitian ini berupaya untuk menjelaskan hubungan kerjasama ekonomi antara negara Indonesia dan Jepang dalam kerangka Indonesia-Japan Economic Partnership Agreement (IJEPA) yang mengarah pada system perdagangan bebas kedua negara. Tidak hanya perdagangan bebas, kerjasama ekonomi tersebut juga mengarah pada upaya pemerintah Indonesia dan Jepang untuk bisa meningkatkan daya saing terhadap beberapa sektor industri di Indonesia. Sejak tahun 2008, perjanjian tersebut efektif diberlakukan oleh kedua negara. Dengan menggunakan metode deskriptif analitik, maka penelitian ini berupaya untuk memberikan gambaran terkait dengan pelaksanaan IJEPA melalui program Manufacturing Industry Development & Economic Cooperation (MIDEC). Sehingga penelitian ini dapat melakukan analisa secara kualitatif guna melihat signifikansi IJEPA serta hambatan hambatan yang muncul. Dengan menggunakan paradigma neoliberalisme maka perspektif penelitian ini mengarah pada sebuah hipotesa, dimana bentuk kerjasama bilateral dalam kerangka IJEPA sebagai sebuah institusi akan mengarah pada upaya liberalisasi perdagangan. Utamanya, untuk menjamin terselenggaranya pasar bebas sehingga memaksa para peserta perjanjian untuk memfokuskan pada keunggulan komparatifnya. Termasuk didalamnya hambatan-hambatan yang dialami, penting untuk menjadi poin analisa guna menyimpulkan bahwa kerjasama yang dilakukan oleh kedua negara belum sepenuhnya sesuai dengan tujuan-tujuannya.

Kata kunci: IJEPA, MIDEC, Neoliberalisme, Liberalisasi Perdagangan, Keunggulan Komparatif